由于具有不同的等级要求，洁净实验室的建设根据百级、万级、十万级等对应着不同的建设标准。通常来说，为达到洁净等级，主要通过工艺布置、建筑平面、建筑构造与装修、空气洁净措施、人员和物料净化、维护管理等渠道来实现。医院手术室净化工程或医疗洁净室，对空气洁净度要求很高。特殊的建筑区域，如隔离室、特定的测试和护理区域还需要使用高效过滤器对空气进行过滤处理。手术室顶部一般采用有效空气过滤系统，覆盖面积达3×3m以上。
洁净实验室设计气源时有两种方法：一种是公园或厂区的集中供应，管道直接连接到使用点；另一种是从气瓶供应气体，气瓶设置在气瓶之间，通过汇流排放送至煤气使用点。"实验区公用管道的接入方式有两种：一种是直接将使用点从地板或地板下连接到使用点，另一种是将管道放置在公用夹层中，通过功能柱或隔墙连接到使用点。注意灭菌器(特别是电加热设备)等大功率设备的电源设计；精密仪器考虑稳压电源和UPS；考虑一些精密仪器的**接地设计；考虑合理的网络、监测和插座设计等。
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