为了使洁净实验室室内保持所需要的温度、湿度、风速、压力和洁净度等参数，常用的方法是向室内不断送入一定量经过处理的空气，以消除洁净室内外各种热湿干扰及尘埃污染。为获得送入洁净室具有一定状态的空气，就需要一整套设备对空气进行处理，并不断送入室内，又不断从室内排出一部分来，这一整套设备就构成了洁净空调系统。洁净空调系统分为集中式与分散式，集中式洁净空调系统又称中央空调，所有空气处理设备(风机、粗、中、高效过滤器、加热器、冷却器、加湿器、除湿器和制冷机组等)都集中在空调机房内，通过输送管道将精密控制处理后的空气分配给空气末端装置，送到净化实验室里，以不同换气次数和气流形式来实现洁净实验室不同的洁净级别。
洁净实验室传递窗的使用方法：从不干净的区域到干净的区域，打开不洁净区域的侧门，并将要传递的物品放入送货窗口。关闭透射窗门，打开紫外线灯至少15分钟并关闭它。在干净的区域打开一扇侧门，取出要送货的物品，然后关上门。从清洁区域进入不洁净区域，打开清洁区域的侧门，将要传递的物品放入送货窗口。关闭送货窗门，在不干净的区域打开侧门，取出要交付的物品，然后关上门。使用每个传递窗后，用消毒剂擦拭转移窗，并无残留，以防止其他物品受到污染。当测试样本进入洁净室时，用消毒剂擦拭外表面，不要打开紫外线照射。检验样品必须与其他物品分开送到洁净室。
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