洁净实验室中，机械仪器设备洁净室和一般生物洁净室都是采用正压维持, 但对于使用有害气体或使用易燃易爆溶剂以及其他有特殊要求的洁净实验室则采用负压控制。 洁净实验室维持一定的正压是保证洁净室不受或少受污染、是维持设计洁净度等级必不可少地条件之一。即便是负压洁净室，它也必须有不低于它洁净度级别地相邻房间或套间维持一定的正压，负压洁净室的洁净度才能得以维持。 洁净室正压值是指门窗全部关闭状态下，室内静压大于室外静压的数值。它是通过净化系统送风量大于回风量和排风量的方法来达到。不同等级的洁净实验室以及实验室内洁净区与非洁净区之间的静压差，应不小于5Pa，洁净区与室外的静压差，应不小于10 Pa.。 此外，洁净实验室对于风量，风速等各项指标的技术要求也都非常严格，因此，空调系统必须能够满足对其参数进行精确的控制。
洁净实验室的规划设计装修应注意的要点：① 医院洁净手术室数量一般按照住院总床位数的2％，或者外科病房总床位数的4％来确定。 ② 普通的县医院洁净室以洁净度（万级）为宜，不需盲目增设高等级手术室，以防造成浪费。 ③ 主要必备用房按照洁净区、洁净区、污染区来划分。④ 洁净手术室不宜在首层和搞建筑的顶层。如果建立在顶层，需多方面考虑无眠的保温隔热及雨水渗透问题。 ⑤ 做好防火分区。 ⑥ 洁净手术室不能增设外窗，应采用人工照明。
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