洁净实验室的主要用途如下：空气洁净室：已建成并可投入使用的洁净室(设施)。它拥有所有相关的服务和职能。然而，该设施中没有由经营者操作的设备。静态洁净室：各种功能齐全，设置正确，可根据设置(设施)使用或正在使用，但设施内没有操作人员。动态洁净室：在正常使用的洁净室中，服务功能完善，有设备和人员；如有必要，可以从事正常工作。"洁净室的清洁程度经常受到空气流动的影响，换言之，人员、机器隔间、建筑结构等产生的灰尘的运动和扩散会影响洁净室的清洁。，被气流控制。洁净室使用HEPA和ULPA过滤空气，除尘率为99。97×99。9995%。因此，这种过滤器过滤的空气可以说是非常干净的。然而，除了人之外，洁净室里还有像机器这样的灰尘源。一旦灰尘扩散，就不可能保持干净的空间，因此有必要利用气流迅速从外部排出灰尘。
洁净实验室中，机械仪器设备洁净室和一般生物洁净室都是采用正压维持, 但对于使用有害气体或使用易燃易爆溶剂以及其他有特殊要求的洁净实验室则采用负压控制。 洁净实验室维持一定的正压是保证洁净室不受或少受污染、是维持设计洁净度等级必不可少地条件之一。即便是负压洁净室，它也必须有不低于它洁净度级别地相邻房间或套间维持一定的正压，负压洁净室的洁净度才能得以维持。 洁净室正压值是指门窗全部关闭状态下，室内静压大于室外静压的数值。它是通过净化系统送风量大于回风量和排风量的方法来达到。不同等级的洁净实验室以及实验室内洁净区与非洁净区之间的静压差，应不小于5Pa，洁净区与室外的静压差，应不小于10 Pa.。 此外，洁净实验室对于风量，风速等各项指标的技术要求也都非常严格，因此，空调系统必须能够满足对其参数进行精确的控制。
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