由于壳寡糖分子中含有较多的氨基和羟基，其分子间或分子内作用较强，分离纯化相对较困难。目前，壳寡糖的分离纯化方法主要有：膜分离法、凝胶渗透色谱法、薄层色谱法和离子交换色谱法等。膜分离技术是20世纪60年代后迅速崛起的一门分离新技术。由于该技术兼有分离、浓缩、纯化和精制的功能，又有高效、节能、环保、分子级过滤及过滤过程简单、易于控制等特征，因此，已广泛应用于食品、医药、生物、环保、化工、冶金、能源、石油、水处理、电子、仿生等领域，产生了巨大的经济效益和社会效益，已成为当今分离科学中重要的手段之一。
植物功能调节剂氨基寡糖素(壳寡糖)可作为植物功能调节剂,具有活化植物细胞，促进植物生长，调节植物抗性基团的关闭与开放,激发植物防御反应,启动抗病基因表达等作用。日本已将氨基寡糖素制成植物生长调节剂,用于提高某些农作物产量。张文清等研究了氨基寡糖素对黄瓜生长的促进作用，结果表明，氨基寡糖素处理过的黄瓜植物不但对霜霉病的抗性增强，而且对果实采收期可提前列~5d，产量明显提高。壳寡糖可有效的诱导植物产生防御反应，激发植物的系统性获得免疫抗性。
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