中央空调系统长期运行后，中央空调系统也会出现生物粘泥现象：因为水中的土壤、沉积物和腐殖质形成污垢，再加上细菌、藻类等微生物及其分泌物形成生物粘泥，严重造成管道堵塞；而污垢、粘土会影响换热效率、能耗，导致高压运行，严重造成超压停机。这些都严重影响空调系统的正常运行。因此，中央空调系统中的结垢、生锈、污泥、细菌和藻类等问题将直接导致制冷能力的降低、使用寿命的缩短、运行可靠性的降低和能耗的增加，从而导致运行成本的增加。为了使中央空调系统在良好的状态下运行，需要对空调系统的冷却水和冷冻水系统进行特殊的化学药品处理包括除垢，除锈，涂泥，除菌，防腐处理等。
中央空调的空调水系统： ①、冷却水系统由于上开启式系统，冷却水通过冷却塔是充分和空气接触，在被冷却的同时也将空气的大量尘埃等杂质被引入水系统中，沉积在冷却塔、空调机组和管道里形成淤泥，降低循环水量，影响热交换。 ②、系统投入使用后，因安装时残留在系统内的焊渣、铁屑、泥土、油污等杂质也会聚积在系统里；焊渣、铁屑等坚硬物质则会附着在换热设备表面，影响换热。 ③、冷却水因和空气接触，在冷却塔中和管道里会滋生藻类、细菌等微生物，其死后的尸体和淤泥、油污等杂物粘附在一起，附着在设备和管道上，影响循环水量及换热，同时，微生物和沉积的产生，促使浓差腐蚀电池的形成及垢下腐蚀的产生，从而使金属的腐蚀速度加剧。冷冻水系统也因经常采用自来水通过水箱换水补水，也会产生上述现象。 ④、冷却水系统水温较高，且均采用自来水，其Ca2+、Me2+离子受热后形成碳酸盐水垢，附着在热设备和管道中，因水垢的导热系数0.464~0.697W/M.K，碳钢的导热系数为46.4~52.2W/M.K，只有碳钢的1%，降低换热设备的传热效果，引起运行成本增加。
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