洁净实验室的主要用途如下：空气洁净室：已建成并可投入使用的洁净室(设施)。它拥有所有相关的服务和职能。然而，该设施中没有由经营者操作的设备。静态洁净室：各种功能齐全，设置正确，可根据设置(设施)使用或正在使用，但设施内没有操作人员。动态洁净室：在正常使用的洁净室中，服务功能完善，有设备和人员；如有必要，可以从事正常工作。"洁净室的清洁程度经常受到空气流动的影响，换言之，人员、机器隔间、建筑结构等产生的灰尘的运动和扩散会影响洁净室的清洁。，被气流控制。洁净室使用HEPA和ULPA过滤空气，除尘率为99。97×99。9995%。因此，这种过滤器过滤的空气可以说是非常干净的。然而，除了人之外，洁净室里还有像机器这样的灰尘源。一旦灰尘扩散，就不可能保持干净的空间，因此有必要利用气流迅速从外部排出灰尘。
例如生物培养室：是进行微生物培养、组织培养、细胞培养等的用房。要求的环境条件相当严苛，包括温湿度、光照、空气、水分、酸碱度等及灭菌消毒等措施，这就对空调通风和空气净化设施和整套系统提出了更高的要求。 即使是对于普通净化实验室的要求，例如电子、航天航空、光电子等，对恒温、恒湿、洁净、无菌、防振、防辐射、防电磁干扰等也有别于普通舒适性空调系统。另外，还有一些饲养生物实验所需动物的房间，虽然从严格意义上来说不属于实验室，但对于实验有着重要的意义，要有良好的除菌灭毒功能，就净化和对空气环境的处理方面对空调通风和洁净等级有着许多特殊的指标。
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